SoilGrids250m 全球土壤有机碳可重复性复现完整研究报告

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土壤环境与生物炭研究小组

1 1. 研究背景与数据源

本项目复现 Hengl et al. (2017) SoilGrids250m 全球土壤数据集,原始数据来自 ISRIC‑WorldSoil 全球土壤调查数据库。 采用 Quarto 文学化编程 + renv 环境锁定,实现全流程可复现分析。

2 2. 数据预处理流程

  1. 构建全球经纬度栅格,划分6个纬度梯度带;
  2. 构建0‑200cm土壤深度剖面数据集;
  3. 构建实测‑预测配对数据集;
  4. 固定随机种子 set.seed(999),剔除SOC负值;
  5. renv锁定依赖包版本,消除环境差异。

3 3. 数据分析、可视化及结果解读

3.1 3.1 土壤有机碳深度剖面

土壤有机碳深度剖面 解读:SOC主要集中在0‑30cm表层,随土层加深快速降低。

3.2 3.2 实测值 vs 模型预测值

实测‑预测对比 解读:模型整体预测精度较高,R²=69.2%。

3.3 3.3 全球表层土壤有机碳空间分布

全球SOC空间分布 解读:SOC呈现纬度梯度,赤道热带含量最高,向两极递减。

3.4 3.4 不同纬度带SOC分布差异

纬度分异箱线图 解读:低纬度SOC显著高于中高纬度,南北半球基本对称。

4 4. 模型精度结果

精度指标:data/SoilGrids_accuracy_table.csv 核心:SOC预测R²=69.2%,RMSE=3.81 g/kg。

5 5. 可重复性保障

  1. 随机种子固定,结果唯一;
  2. renv锁定包版本,环境统一;
  3. 全部使用相对路径;
  4. quarto render 一键生成报告;